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从养殖池污泥中分离一株对孔雀石绿具有较强降解活性的细菌M6，通过革兰氏染色、电镜技术对其形态进行了观察，用API细菌鉴定系统对其生理生化特性进行了研究，通过对其16S rDNA进行PCR扩增和测序，与NCBI中收录的与其同源性较高的菌株进行了聚类分析并构建了系统发育树，并进一步探讨了其脱色机理。实验结果表明，菌株M6革兰氏染色阴性，杆形，端生一根鞭毛，大小约为0.32 μm×0.68 μm，在含孔雀石绿的普通营养琼脂平板上形成的菌落特征为圆形、绿色、粘稠、不易挑取：其对孔雀石绿主要为降解脱色，在30℃、150 r／min条件下对孔雀石绿的脱色率为97.14[％]：菌株M6与GenBank基因库中假单胞菌属的细菌菌株自然聚类，同源性在98[％]～99[％]，与恶臭假单胞菌OW-16(登录号：DQ112328.1)的亲缘关系最近。结合传统的形态与生理生化特性鉴定以及16S rDNA系统发育分析鉴定的结果，判定菌株M6为恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)(登录号：EU348741.1)。