【摘 要】
：
[目的]畜禽肠道是抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的存储库.畜禽肠道中大部分菌群无法通过传统分离培养的方法进行研究.本文通过宏基因组学首次深度解析肉鸡肠道菌群耐药基因谱.[方法]本文采集54只肉鸡粪便样品,提取宏基因组,进行Illumina HiSeq 4000测序,测序策略为PE 150 bp.运用生物信息学技术分析ARGs 的丰度和多样性,并且
【机 构】
：
华南农业大学兽医学院/家兽药安全评价(环境评估)实验室/国家兽药残留基准实验室/国家兽医微生物耐药性风险评估实验室,广州,510642
【出 处】
：
中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十四次学术讨论会
论文部分内容阅读
[目的]畜禽肠道是抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的存储库.畜禽肠道中大部分菌群无法通过传统分离培养的方法进行研究.本文通过宏基因组学首次深度解析肉鸡肠道菌群耐药基因谱.[方法]本文采集54只肉鸡粪便样品,提取宏基因组,进行Illumina HiSeq 4000测序,测序策略为PE 150 bp.运用生物信息学技术分析ARGs 的丰度和多样性,并且定位ARGs 的宿主菌,明确整合子、质粒和噬菌体上的ARGs排列情况.
其他文献
[目的]本研究旨在探讨转座子介导化脓隐秘杆菌的耐药机制.[方法]运用细菌基因组DNA提取试剂盒，提取34株化脓隐秘杆菌分离株基因组DNA.根据GenBank中发表的细菌中常见转座子的基因序列，设计相应的特异性引物，采用PCR方法扩增化脓隐秘杆菌分离株基因组DNA中转座子IS26、tnp513、tnpA、tnpU、tn1721、merA的基因片段，纯化回收后，与pEASY-T1克隆载体连接，转入到大
[目的]探讨外排泵抑制剂利血平对化脓隐秘杆菌大环内酯类药物耐药性的影响，揭示化脓隐秘杆菌对大环内酯类药物的耐药机制，为抗耐药菌新药的研发提供新的思路。[方法]采用肉汤微量稀释法测定联合利血平前后，红霉素、罗红霉素、乙酰螺旋霉素、泰乐菌素等4种大环内酯类药物对携带外排基因msrA、mefA的化脓隐秘杆菌分离株的MIC值。
[目的]探讨宁夏地区牛源金黄色葡萄球菌生物被膜形成与耐药性之间的关系.[方法]对分离于牛乳源的8株MRSA菌株和42株MSSA进行药敏试验,并对其进行刚果红琼脂试验,同时用PCR方法对菌株的生物被膜相关基因icaA、sarA、fnbA、fnbB进行检测.[结果]刚果红琼脂试验MRSA阳性有6株(75％),MSSA 阳性有30株(71.4％)；在 MRSA 中,icaA、sarA、fnbA、fnbB
[目的]本研究于2016年至2017年分析了江苏地区的4个猪场猪源屎肠球菌及粪肠球菌的耐药表型，同时对噁唑烷酮类耐药基因cfr及optrA进行检测，阐明了噁唑烷酮类的耐药机制，且为江苏地区猪链球菌病临床用药的选择提供切实的指导方案.[方法]采集猪的肛门拭子，肠球菌肉汤分离纯化及PCR鉴定屎肠球菌及粪肠球菌.参考CLSI推荐的肉汤微量稀释法检测分离株对11种抗菌药物的敏感性，同时采用PCR方法检测噁
[目的]本研究主要对江苏地区的8个猪场进行猪链球菌的分离鉴定及耐药表型与基因型的检测，为江苏地区猪链球菌病临床用药的选择提供切实的基础数据。[方法]临床无菌采集病猪的脏器及病猪与健康猪的鼻拭子样本，采用革兰氏染色镜检及PCR检测谷氨酸脱氢酶基因gdh进行分离鉴定。
[目的]目前关于NDM 基因在猪和鸡源细菌中的流行病学报道较多,而缺少奶牛源细菌中该基因的相关研究,本项目拟调查国内奶牛源革兰氏阴性细菌中NDM 基因的流行情况并阐明其分子传播机制。[方法]选择江苏地区典型的奶牛场,同时采集奶牛的粪便样本和牛奶样本,使用选择性培养基分离碳青霉烯耐药细菌,PCR检测碳青霉烯类相关耐药基因,通过药敏试验测定耐药菌的敏感性,使用分子分型(MLST/PFGE)方法分析菌株
[目的]化脓隐秘杆菌(Trueperella pyogenes)是一种重要的条件致病菌，由于滥用抗生素导致该菌的耐药性逐渐升高，而在国内还没有关于化脓隐秘杆菌的耐药机制的研究。本文目的在于研究我国吉林省地区分离到的化脓隐秘杆菌的耐药机制，以期为新型防治技术以及新型药物与耐药抑制剂的研发提供一定的数据支持。
[目的]牛A 型多杀性巴氏杆菌(Pm)耐药性的产生为其引发疾病的治疗增添了困难，为此本研究对Pm耐药性和常用药物的分子耐药机制进行研究，为该病原耐药抑制剂的研发奠定基础。[方法]首先对病原进行耐药性检测，分析耐药表型和基因型，然后采用PCR和分子对接对喹诺酮和大环内酯药物靶位进行分析。同时采用CCCP 和MRM 对外排蛋白进行检测。最后构建RNA-Seq 测序文库，筛选耐药株差异表达基因。[结果]
[目的]兽用氟喹诺酮类药物恩诺沙星是治疗鸡沙门氏菌感染的重要药物,本实验旨在采用不同剂量恩诺沙星治疗鸡沙门氏菌感染,研究治疗过程中鸡肠道微生物菌群组成、结构和功能随给药的变化。[方法]本实验选用20只4日龄SPF健康雏鸡人工感染攻毒沙门氏菌CVCC541,疾病模型构建成功后,将雏鸡随机分为四组,每组5只,包括一个空白对照组和三个给药组。雏鸡8日龄时开始经口灌服高,中,低剂量恩诺沙星进行治疗。
[目的]为了监测耐药性产生,分析耐药现状和发展规律,更科学地指导临床用药和新药开发,本课题参考CLSI 中折点制定的方法建立了副猪嗜血杆菌对替米考星的野生型折点和药效学折点.[方法]使用CLSI 推荐的琼脂稀释法对临床分离及其它实验室赠送的103 株副猪嗜血杆菌进行MIC测定,利用统计学分析软件对测得的MIC 数据进行非线性回归分析确定其野生型折点.根据根据副猪嗜血杆菌SH0165株MIC 的测定