【摘 要】
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蛋白质和核酸是组成生命最为重要的生物大分子,蛋白质-核酸相互作用在生命活动中发挥了一系列非常重要的功能,是人们了解基因表达具体机制、揭开生命奥秘的关键所在。在蛋
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蛋白质和核酸是组成生命最为重要的生物大分子,蛋白质-核酸相互作用在生命活动中发挥了一系列非常重要的功能,是人们了解基因表达具体机制、揭开生命奥秘的关键所在。在蛋白质-核酸相互作用中,蛋白质侧链和核酸的碱基的相互作用占相当大的比例。[1-2]利用ab initio 和ABEEMσπ/MM 浮动电荷力场[3]研究氨基酸侧链和碱基的相互作用的相关性质:几何构型、氢键、电荷分布和相互作用能等方面。拟合了精确表述氨基酸侧链和碱基相互作用的势能函数,优化ABEEMσπ/MM 浮动电荷力场参数使其相关性质与从头算结果有很好的一致性。为进一步应用ABEEMσπ/MM 浮动电荷力场研究蛋白质和核酸的相互作用奠定了基础。
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