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为了明确在辽宁省核果上广泛发生的李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ring spot virus,PNRSV)基因组特征、遗传重组情况,根据已经发表的PNRSV基因组序列设计了3对特异引物及5′RACE和3′RACE引物,用高保真酶(KAPA HiFi HotStart ReadyMix)对五个中国东北分离物(Peach 1、Peach 4、YTL1、Cherry 1、Cherry 2)的PNRSV进行RT-PCR扩增、克隆、测序和拼接.结果显示,五个中国东北PNRSV分离物的基因组RNA1长度分别为：3332、3332、3332、3332、3331 nt；RNA2长度均为2591 nt；RNA3长度分别为：1943、1943、1950、1950、1950 nt.RNA1和RNA2分别编码分子量为117KDa和91KDa的复制酶相关蛋白,RNA3编码两个不重叠的ORF,ORF1为283个AA的MP,ORF2为224或226个AA的CP.通过核酸一致性分析,五个中国东北分离物的RNA1核酸一致性在94.5-99.8％之间,与已经公布的5个分离物间的核酸一致性在91.8-98.7％之间；五个中国东北分离物的RNA2核酸一致性在92-99.9％之间,与已经公布的5个分离物间的核酸一致性在91.5-99.3％之间；五个中国东北分离物的RNA3核酸一致性在94.8-100％之间,与已经公布的13个分离物间的核酸一致性在87.5-99.1％之间.基于MP、CP和全长RNA3序列的系统发育分析证明Peach 2、Peach 4分离物属于PV96组,YTL 1、Cherry 1、Cherry2 分离物属于PV32组.在Cherry1株系的基因组RNA1和RNA2组分中均检测到了重组事件的发生.