DNA序列分析的现代信号处理方法初探

来源 :2003年中国科协“生物信息学与进化计算”青年科学家论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:j395188088
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识别编码区或寻找基因是DNA序列分析中最关键的工作。本文主要探索了现代信号处理方法用于解决编码区识别以及基因定位等问题的科学性、有效性和准确性。在分析了传统方法弱点的基础上,提出用两种现代频谱分析法—AR模型法和MUSIC法实现对蛋白编码区的预测,计算机仿真实验证实了两种新方法的有效性。通过比较发现,两种新方法在DNA序列谱质量、分辨率和预测准确性等方面均优于传统方法;接着,以小波变换为分析工具,对DNA序列频谱进行包分解,并对峰值进行重构来实现蛋白编码区的定位,仿真实验表明基于小波变换的方法定位编码区准确性高、分析速度快,还有助于发现DNA序列中新的生物学规律。
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