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异基因造血干细胞移植是目前唯一能治愈MDS的方法，但仅四分之一患者能采取移植治疗。约半数患者因高龄、肌体条件限制无法行干细胞移植，或系低危组MDS采取其他治疗手段。约25％的患者虽然是移植适应症，但因无合适供体等原因，无法行此治疗。仅约25％的MDS患者能采取干细胞移植治疗，其中HLA相合同胞供者及无关供者各占10％。脐血移植或其他的HLA不全相合移植占5％。