适用于荧光定量PCR最佳真菌核酸提取方法探讨

来源 :中华医学会第十八次全国儿科学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangjie333666
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:核酸提取是进行PCR检测成功的保证,特别是对于临床血标本中微生物核酸的提取,但有时对于荧光定量PCR,还应考虑提取方法是否对荧光定量PCR体系有影响,因而通过对用于荧光定量PCR多种真菌核酸提取方法进行比较.探索出适用于荧光定量PCR扩增的最佳真菌核酸提取方法.方法:分别采用一步裂解法、Lyticase酶消化法、玻璃珠破壁法、Biospin膜吸附法、磁珠法、浓缩裂解法、浓缩裂解结合加热法等方法对定量标准念珠菌及标准隐球菌进行DNA提取,比较DNA提取量,同时将标准株储存液用生理盐水进行10倍倍比稀释成107~100CFU/ml,分别按照上述7种方法提取DNA,以此作为PCR反应模板进行实时荧光定量PCR,并获得标准曲线,通过对每个不同浓度的标准株荧光曲线形状及各浓度荧光曲线相关性的大小进行分析.结果:7种方法DNA提取量无统计学差异,但对一步裂解法、Lyticase酶消化法、玻璃珠破壁法、Biospin膜吸附法、磁珠法、浓缩裂解法、浓缩裂解结合加热法提取真菌DNA进行实时荧光定量PCR的效果比较,浓缩裂解法和浓缩裂解结合加热法的扩增曲线呈典型的“S"型,并且浓缩裂解结合加热在检测同种真菌同一浓度时Ct值明显靠前,方差分析P <0.05,说明浓缩裂解结合加热的方法是实验比较后获得的念珠菌和新型隐球菌DNA提取并进行实时荧光定量PCR扩增的最佳方法,具有统计学意义。结论:在进行标准念珠菌及标准隐球菌荧光定量PCR检测中采用浓缩裂解结合加热获得DNA方法最佳。
其他文献
会议
本文通过回顾分析具有19例川崎病样改变的腺病毒肺炎与13例典型川崎病患儿的临床特点、实验室检查以及治疗,比较分析具有川崎病样改变的腺病毒肺炎与典型川崎病的临床特点,旨在加强对腺病毒肺炎的认识.川崎病样改变的腺病毒肺炎与典型川崎病既有相似之处亦有不同特点,诊断需要结合临床特点,实验室检查,心脏彩超等综合分析。
本文为了了解腺病毒肺炎儿童的混合感染情况.收集2007年9月至2011年8月诊断为急性下呼吸道感染的住院患儿鼻咽抽吸物标本3140份,采用PCR方法检测常见的12种呼吸道病毒,包括呼吸道合胞病毒(RSV)、鼻病毒(HRV)、流感病毒A-B (IFVA-B)、副流感病毒1-3 (PIV1-3)、偏肺病毒(HMPV)、冠状病毒NL63 (NL63)、冠状病毒HKU1 (HKU1)、腺病毒(ADV)和博
会议
目的:探讨结核杆菌DNA微阵列芯片技术用于诊断儿童结核病的临床应用价值.方法:采集住院儿童的70份临床诊断结核病及50份非结核病患儿的标本,每份标本分别进行抗酸染色、分枝杆菌培养以及结核杆菌DNA微阵列芯片检测,比较DNA微阵列芯片检测结果与抗酸染色镜检和分枝杆菌培养的结果.结果:DNA微阵列芯片检测结核病患儿分枝杆菌的敏感性为24.3% (17/70),涂片抗酸染色敏感性为17.1% (12/7
目的:对九江地区冬春季急性下呼吸道感染(ALRI)的住院患儿进行呼吸道病毒感染监测,探讨其流行规律.方法:选择2008-2012年冬春季在医院呼吸内科住院ALRI患儿,取入院当天并病程第5天静脉血,进行呼吸道病毒IgM监测,包括呼吸道合胞病毒(RSV),腺病毒(ADV)、流感病毒(IV)、副流感病毒(PIV),并对检查阳性标本的病例进行统计学分析.结果:通过对4年冬春季918例标本监测,呼吸道病毒
目的:通过检测EBV感染患儿CD14+细胞膜表面CD163与血清中相应的sCD163,分析两种不同存在形式之间的关系,并探讨其与患儿临床表现、疗效及预后的关系.方法:应用酶联免疫法检测患儿血清sCD163,流式细胞术检测患儿外周血单核细胞表面CD163的表达.结果:①入选病例75例,其中普通感染组24例,重症感染组9例,IM组34例,HLH组8例,血清sCD163分别为4190±1733ng/mL
目的:通过检测EBV感染患儿血清铁蛋白(SF),探讨SF在EBV相关噬血细胞综合征(EBV-AHS)的诊断、病情监测及预后中的意义.方法:应用化学发光法检测患儿SF.结果:①入选病例103例,其中普通感染组39例,重症感染组9例,IM组47例,HLH组8例,SF分别为113ug/L、1128ug/L、176ug/L、31287ug/L.其中3例HLH患儿SF大于检测上限40000ug/L,HLH组