【摘 要】
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针对鲤(Cyprinus carpio)这一主要水产养殖品种设计并优化了靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)分子标记的反应体系：在15 μl PCR反应体系中,Mg2+浓度为1.5mol/L、dNTPs浓度为0.35mmol/L、随机引物浓度均为6 pmol/L、固定引物浓度为10 pmol/L、含DNA模板60 ng、 Taq
【机 构】
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南京农业大学动物科技学院 南京 210095;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室 无锡 214081;南京农业大学无锡渔业学院 无锡 214081
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针对鲤(Cyprinus carpio)这一主要水产养殖品种设计并优化了靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)分子标记的反应体系：在15 μl PCR反应体系中,Mg2+浓度为1.5mol/L、dNTPs浓度为0.35mmol/L、随机引物浓度均为6 pmol/L、固定引物浓度为10 pmol/L、含DNA模板60 ng、 Taq DNA聚合酶1.0U.运用TRAP标记技术,选取10个多态性较好的引物组合对建鲤、黄河鲤、黑龙江野鲤、荷包红鲤和兴国红鲤等5个鲤群体进行遗传多样性进行分析.结果表明,共扩增出168个位点,其中多态性位点134个,平均多态性比率80.41％,平均多态性信息含量0.29.分子变异方差分析(AMOVA)表明鲤群体遗传变异主要存在于群体内个体间(96.97％),只有3.03％遗传变异存在于群体间.种群再分效应固定指数(FST=0.03026,P＜0.05)表明鲤群体间有明显的遗传分化.基于目标候选基因TRAP标记的聚类结果表明建鲤和兴国红鲤首先聚成一类,然后黄河鲤和黑龙江野鲤聚为一类,再与荷包红鲤聚为一类.对改良系鲤及其原始亲本进行TRAP分析时,在改良系中发现一条区别于双亲的特异条带.本研究表明TRAP技术灵敏度高,适用于鲤群体的遗传多样性研究,在鲤鱼分子标记辅助育种方面具有应用潜力.
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