【摘 要】
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线粒体基因组序列在后口动物进化研究中有着重要的作用.本研究使用PCR方法获得糙刺参(Stichopus horrens)线粒体全基因组序列.该序列全长16257 bp，包含13个蛋白编码基因，22
【机 构】
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中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点研究室广东省应用海洋生物学重点实验室,广州 510301 中国科学院研究生院，北京 100049
【出 处】
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第五届中国生物产业大会——2011基因科学与产业发展论坛
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线粒体基因组序列在后口动物进化研究中有着重要的作用.本研究使用PCR方法获得糙刺参(Stichopus horrens)线粒体全基因组序列.该序列全长16257 bp，包含13个蛋白编码基因，22个tRNA基因和2个rRNA基因.除了一个蛋白编码基因(nad6)和5个tRNA基因(tRNA Ser(UCN),tRNA Gln,tRNAAla,tRNA Val，tRNA Asp)在轻链上编码外，其余的基因都在重链上编码.糙刺参线粒体重链碱基有30.8％A，23.7％C，16.2％G，和29.3％T构成.假定的线粒体控制区长675 bp.基因间间隔碱基长1-50bp，共227 bp.11个基因间有重叠碱基，长1-10 bp，共25bp.13个蛋白编码基因起始密码子均为ATG，终止密码子大多为TAA(nad3和nad4的为TAG).亮氨酸编码频率最高(16.29％)，随后是丝氨酸(10.34％)和苯丙氨酸(8.37％).所有的22个tRNA基因均能折叠成三叶草结构.通过和其他4种海参的线粒体基因排列顺序比较，本研究发现糙刺参的线粒体基因排列顺序是一种新的排列方式.
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