高通量测序数据中家蚕环形RNA的筛选与鉴定

来源 :华东六省一市生物化学与分子生物学学会2014年学术交流大会暨浙江省第十一届学会会员代表大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiandande
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基于环行RNA的结构特征和形成特点,开发了一个环行RNA预测软件,该软件可以从去除rRNA的总RNA高通量测序数据中预测环形RNA的存在。利用该预测软件分析家蚕数据库中去核糖体总RNA高通量测序数据,预测了300多个家蚕体内可能存在的环形RNA基因片段,这些潜在的环行RNA基因的剪切边界中都符合AG和GU特征,进一步实验验证,对选择的预测环形RNA进行相对引物和相反引物的PCR鉴定,与相应基因组对照的PCR结果进行比较,环行RNA基因的相对和相反引物都能够扩增出预期的目的条带。PCR鉴定阳性的环形RNA进一步进行Northern Blotting鉴定。同时,生物信息学分析表明,这些环行RNA存在大量的家蚕microRNA结合位点。通过实验检测结合生物信息学方法,在家蚕中成功鉴定了大量环形RNA分子,对研究环形RNA分子在家蚕中的基因调控功能打下基础。
其他文献
会议
随着初中历史新课改的不断深入,创建高效课堂已成为我们广大历史教师追求的目标。高效课堂是一种高效率的教学过程,它主要表现为教师高效地教、学生高效地学;它是一种融初中生认
会议
推动文献资源建设,对社院系统图书馆来说,既是难点又是困点.可征集本区域统一战线单位和个人文献,以之为先导,使未来的统一战线文献中心,集专业性、知识性、文化性、品牌性于
2003年:巴菲特买进中国石油,激发投资者热情,三大石油公司涨幅惊人去年,有两大因素导致投资者追捧中国三大石油公司股票,那就是:全球油价居高不下,市场对各国的石油公司都很关注;而盘
深入学习贯彻党的十九届五中全会精神,是当前和今后一个时期佛教界的一项重大政治任务.为此,中国佛教协会将引领全国佛教界做好以下工作:rn一、开展学习宣传活动,团结带领全
期刊
一、高度重视,统筹谋划公共课建设.云南省民宗委坚持把抓好公共课建设作为办好宗教院校的重要基础,作为坚持正确办学方向的重要举措,作为坚持我国宗教中国化方向的必然要求,
期刊
山西省晋城市公路分局下辖6个公路段和7个直属单位,承担着晋城市境内9条国,省道计690公里干线公路的养、建、管、营任务。2000年至2001年,晋城市公路分局进行了以公路段改革