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植物基因组中存在广泛的DNA甲基化变异，这种变异主要发生在CpG和CpNpG。真核生物的DNA甲基化修饰可通过自己特有的方式传递到下几代，在某种情况下外界因素的影响也会导致这种相对稳定的表观遗传状态发生变化，而改变原来的甲基化水平和模式。本研究在进行DH群体植株性状调查中发现了与父母本不同的性状，父本和母本的性状包括有蜡质、梗短、白球、早熟等，从经典遗传学上分析，DH群体应保持与父本母本相同的性状，但是群体中却发现了无蜡质、梗长、黄绿球、晚熟等变异性状，本研究以这些不同农艺性状花椰菜为材料，利用MSAP技术对花椰菜DH群体中四组具有相对性状的植株进行基因组DNA的甲基化分析，旨在表观遗传学水平上揭示这些变异产生的原因。结果揭示花椰菜基因组DNA甲基化的水平及其变化可以使我们从基因表达调控的角度了解相关性状的机理，使人类存认识的同时更好的加以利用。