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通过形态特征和SSR标记，对蒺藜苜蓿(Medicago truncatulaGaertn.)种质资源进行了鉴定和筛选，选配两个差异较大的蒺藜苜蓿亲本W5160和Jemalong进行杂交，获得杂交组合W5160xJemalong，进而构建了蒺藜苜蓿的F2群体，并应用植物数量性状主基因一多基因分离分析法对该群体的相关性状进行了多个世代的联合分析。结果表明，19个不同来源的一年生苜蓿遗传多样性丰富。Jemalong、DZA、Caliph等种质问有较大差异。W5160xJemalong组合一级侧枝长度以及种子产量的遗传模式为两对加性。显性-上位性主基因+加性一显性多基因模型。该组合分离世代F2群体侧枝长度、百荚重、种子产量等农艺性状的遗传以主基因为主,多基因遗传率相对较低，在育种中应重在主基因的利用，兼顾多基因的积累。