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为了解南方某水源水库中藻类和藻毒素污染状况，探讨适用于水库藻毒素连续、批量的常规监测技术方法，对水源水库中藻细胞密度、藻种、微囊藻毒素(MC)-LR、RR、YR含量进行了监测。结果表明，蓝藻在夏秋季比例较高，微囊藻毒素和蓝藻密度成一定的正相关性，但蓝藻密度和藻毒素的分布规律并不完全一致，MC含量的峰值比蓝藻密度峰值滞后。因此，对蓝藻密度进行在线监测是十分必要的，并建议当蓝藻密度接近或超过限值时应进一步用ELISA方法定性和用HPLC方法定量测定微囊藻毒素含量，形成适用于水源水库的藻毒素监测技术。