美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区序列多态性分析

来源 :2011年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wxpsth
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采用直接测序法对美丽硬仆骨舌鱼(Scleropages formosus)3个种群(金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼)共24个个体的线粒体D-loop部分序列分析.经序列比对,分析的D-loop序列长度为有915~924 bp,其中17个为简约性信息位点,定义了10种单倍型,金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间没有共享单倍型,单倍型多样度在0.667~1.00之间,核苷酸多样度较低(0.00109~0.0033).AMOVA分析显示变异主要来自地理区内不同群体间,个体间遗传距离为0 ~0.008 7,遗传分化程度较低.NJ、MP和Bayesian构建的分子系统树拓扑结构基本一致.由于美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区个体变异程度较大,可作为一种有效的分子标记用于其种内基因变异和种群遗传学研究.
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