【摘 要】
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目的：应用转录组学及生物信息学方法,分析角朊细胞(keratinocytes,KC)在口腔黏膜适应性免疫反应不同阶段的转录谱,发现与KC免疫调控作用相关的关键基因.方法：以本课题组前
【机 构】
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510055广州,中山大学光华口腔医学院·附属口腔医院·口腔医学研究所
【出 处】
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广东省口腔医学会第三次会员代表大会暨第十次学术会议
论文部分内容阅读
目的：应用转录组学及生物信息学方法,分析角朊细胞(keratinocytes,KC)在口腔黏膜适应性免疫反应不同阶段的转录谱,发现与KC免疫调控作用相关的关键基因.方法：以本课题组前期构建的小鼠口腔迟发型超敏反应样炎症模型为载体,收集免疫反应的不同时点(0时,激发后48 h及激发后96 h)的KC,提取RNA后进行芯片实验,分析差异基因.进行RT-PCR和western-blot验证差异基因后,应用GeneSpringGX software v11.0软件(美国Stratagene-Agilent公司)构建了48、96 hr的KC差异基因相互作用网络,并从中选取关键节点.结果：在免疫反应早期(48 h)KC转录组分析发现666个差异基因,而在免疫反应晚期(96 h)发现993个差异基因.通过GO分析发现不同时点的差异基因参与不同的生物学功能,其中48 h差异基因发挥的生物学功能与免疫反应密切相关,例如抗原呈递、调节T细胞介导的细胞活动.同时差异基因参与的通路例如MAPK通路在免疫反应中发挥关键作用.通过差异基因相互作用网络(BANs)发现口腔黏膜免疫反应过程中KC表达的关键基因,如IL-1α,其调控的靶基因包括CXCL1、CXCL10、ICAM1、PTGS2和ADM,可能是后续研究中易于取得突破又具有重要免疫学意义的切入点.结论：角朊细胞在参与口腔黏膜免疫反应,并发挥重要调控作用.
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