【摘 要】
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目的 以粪肠球菌为宿主菌,从医院的污水中筛选出相应的粪肠球菌噬菌体vB_E.faecalis_IME195,本文简称为IME195,分析该噬菌体的生物学特性,并通过高通量测序得到其全基因
【机 构】
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军事医学科学院微生物流行病研究所 北京 100071
【出 处】
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中国生物工程学会第六次全国会员代表大会暨第九届学术年会
论文部分内容阅读
目的 以粪肠球菌为宿主菌,从医院的污水中筛选出相应的粪肠球菌噬菌体vB_E.faecalis_IME195,本文简称为IME195,分析该噬菌体的生物学特性,并通过高通量测序得到其全基因组,深入研究其基因组学特征.方法 我们利用医院的污水,将污水进行浓缩,以临床的耐药粪肠球菌为宿主菌,通过原液点滴法筛选噬菌体,纯化并进一步检测其效价,研究其最佳感染复数(MOI)和一步生长曲线,通过投射电子显微镜观察其形态,大量培养后取适量噬菌体原液通过蛋白酶K/SDS法提取全基因组,Ion Torrent高通量测序,获得全部序列,对其进行拼接注释.结果 通过原液点滴法得到噬菌斑,边缘分明,斑体透明的裂解性噬菌体IME195最佳感染复数为0.01,一步生长曲线显示IME195的潜伏期为40min,爆发量为58,电镜观察该噬菌体为短尾噬菌体,通过BLastx初步确定为尾病毒目,短尾噬菌体科,基因测序表明,噬菌体IME195,大小为18607bp,通过Rast进行基因功能注释,CGView构建全基因组图谱.结论 按照国际病毒分类委员会的标准,该噬菌体IME195属于短尾噬菌体科(podoviridae)烈解性噬菌体,爆发时间较短,运用生物信息学深入分析了噬菌体的基因组学方面无毒力基因,适合用于噬菌体治疗或与药物联合使用.
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