条锈病是我国小麦生产上的重要病害,利用抗病性是控制小麦条锈病最经济有效的措施。由于条锈菌的毒性变异频繁,常常导致全生育期抗病品种丧失抗锈性而失去利用价值。小麦成株抗条锈性具有抗性持久的特征,目前在抗病品种选育与应用中受到广泛重视。然而,成株抗性品种其抗病性由苗期的感病转变为成株期抗病的内在调控机理尚未清楚。本研究应用新一代高通量测序技术Illumina SolexaⅡ对小麦兴资9104苗期和成株期叶片分别进行转录组测序,并通过生物信息学分析成株期与苗期差异表达基因,挖掘其中参与成株抗性的小麦基因。测序结果显示,兴资9104转录组测序共获得157689条Unigene,其中苗期转录组测序获得109606条Unigene,成株期获得159931条Unigene。通过FDR≤0.001且(log2Ratio)≥1参数进行筛选,共获得27204个在苗期和成株期差异表达基因,其中苗期上调的为13976个,成株期上调的是13228个。另外,本研究还获得了大量抗病相关基因,其中在苗期特异表达表达的抗性基因为221个,在成株期特异表达表达为107个。这些基因的获得为后续基因的功能分析,及其小麦抗条锈性的遗传改良奠定了重要基础。