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柑橘溃疡病是由地毯草黄单胞杆菌柑橘致病变种(Xanthomonas axonopodis pv.citri)引起的柑橘毁灭性病害,为国内外检疫性病害.本研究从广西、江西、贵州、四川等地采集柑橘溃疡样品,运用特异性引物xac01/xac02进行分子鉴定为阳性样品.根据Xanthomonas axonopodis pv.citri 306串联重复序列位点设计引物,对假定蛋白基因xac1642、假定蛋白基因xac4111、鞭毛蛋白基因AE008923等基因位点PCR扩增琼脂糖凝胶电泳发现电泳条带出现差异,克隆测序分析结果表明,这些差异是由重复序列中重复数的缺失所致.本实验结果可为运用多位点串联重复序列分析研究柑橘溃疡病病原菌的种群分化、遗传多样性提供了来源.