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通过对水母触手cDNA文库的EST分析，得到一个576bp的编码水母半胱氨酸蛋白酶抑制剂的全长cDNA序列。它的读码框编码131个氨基酸残基的前体蛋白，包括18个氨基酸的信号肽和113个氨基酸的成熟蛋白。氨基酸序列分析表明，水母半胱氨酸蛋白酶抑制剂Cystatin J与第二类半胱氨酸蛋白酶抑制剂有明显同源性，而且具有典型的功能域及保守的二级结构。另外，水母半胱氨酸蛋白酶抑制剂CystatinJ还有一些新的特点，例如，高度保守的羧基端疏水残基对Pro-Trp被Ser97-Trp98所取代以及在系统进化树上处于一个单独的分支，这都说明水母Cystatin J是半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族的一个全新成员，将其归为第四类半胱氨酸蛋白酶抑制剂。进一步构建了pETTrx-Cystatin J原核表达载体，进行了诱导表达，并摸索了重组Trx-Cystatin J在大肠杆菌中的表达条件，获得了具有良好可溶性的重组蛋白。通过Ni2+螯和层析及SP阳离子交换层析等纯化步骤得到了高纯度的重组Cystatin J成熟蛋白。对重组Cystatin J的生物学性质进行了研究，发现重组Cystafin J对木瓜蛋白酶具有明显的抑制作用，抑制常数Ki约为0.5nm。在4℃条件下，该蛋白的抑制活性在pH 4～11范围内均保持在80％以上；在pH6.2条件下，当温度高于50℃时，该蛋白抑制活性呈下降趋势。Arrhenius曲线显示该蛋白的热变性活化能为10.2 kcal/mol。这都显示，水母半胱氨酸蛋白酶抑制剂Cystatin J具有良好的应用前景。