真江蓠线粒体基因组研究

来源 :第四届全国藻类多样性和藻类分类研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:MagicStone2005
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  真江蓠(Gracilaria vermiculophylla)是红藻门江蓠科江蓠属海藻,是重要的大型产胶海洋红藻,具有重要的经济价值,在食用、提取琼胶和作为鲍鱼饵料等方面被广泛利用.本研究利用PCR 扩增方法首次测定了来自中国和俄罗斯的两株真江蓠线粒体基因组全序列.其线粒体DNA 为双链环状结构,序列长度25973/25971 bp,A+T 含量72.0%,编码47个基因,其中24 个蛋白编码基因,2 个核糖体RNA 基因(rRNA),21 个转运RNA 基因(tRNA).基因在两条链上沿相反方向编码,表明具有两个不同的转录单元,所有的基因均没有内含子插入,且均以ATG 作为起始密码子;除atp8 和rpl16 基因使用TAG 作为终止密码子之外,其它基因均使用TAA 作为终止密码子.研究发现,真江蓠与9 种已报道的真红藻纲线粒体基因组具有很强的保守性,基因数目和排列方式几乎完全一致,基因和序列之间都具有很好的共线性关系.在真江蓠线粒体secY与rps12 基因之间存在25 bp 的重叠区,这是真江蓠较其它红藻线粒体基因组所特有的.此外,两株真江蓠的线粒体基因相当保守,有11 个基因完全保守,其余仅存在几个位点的变异,且均未造成移码突变或转录的提前终止.江蓠科(Gracilariaceae)物种的线粒体基因的变异率在15%~55%之间,大多在20%左右,纵观已发表红藻门线粒体基因组,最保守的基因是cox1,而变异率最高的是sdhC,且所有基因属内变异率均小于科内变异率.联合13个线粒体蛋白编码基因对61 个藻类物种的系统进化分析结果显示:所有物种形成五个大的相互独立的进化枝,16 个红藻门物种以较高的支持率单独聚为一支且按各自类群分为3 小支,其中江蓠科内部,江蓠属和龙须菜属明显区分开来,结果表明基于线粒体基因组构建的系统发育树能够较为真实的反映出物种的进化历程.
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