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准确的连锁图谱是开展遗传研究、基因定位、精细定位和克隆的前提。随着分子生物学理论和实验技术的不断发展,出现了大量高通量分子标记,为高密度遗传连锁图谱的构建提供了可能。但是,标记数量的增加也对构建连锁图谱算法的要求越来越高。构造连锁图谱问题常常被看作经典的邮递员问题(traveling salesman problem,简记TSP),本研究提出利用求解TSP的矩阵胚理论(matroid theory)贪心算法(简称TSP-MGA),对分群后的标记进行排序,模拟不同标记个数、标记密度、群体类型、缺失率下的连锁图谱,分析这些因素对构建连锁图谱的影响,通过与已有方法的比较研究说明TSP-MGA在构建高密度连锁图谱中的有效性。