【摘 要】
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芦笋是一种重要的药食同源性保健型蔬菜.为了探明芦笋在天门冬科中的进化位置,通过Hiseq4000高通量测序对栽培芦笋品种Atlas雄株进行测序,并选取天门冬科中的42种植物进行叶绿体基因组的进化分析.芦笋叶绿体基因组结构和系统进化位置的阐明,可为下一步利用叶绿体基因工程和远缘杂交改良芦笋栽培种打下基础.结果表明,芦笋的叶绿体基因组为一环状DNA分子,全长为156 699 bp(NCBI登录号:NC
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芦笋是一种重要的药食同源性保健型蔬菜.为了探明芦笋在天门冬科中的进化位置,通过Hiseq4000高通量测序对栽培芦笋品种Atlas雄株进行测序,并选取天门冬科中的42种植物进行叶绿体基因组的进化分析.芦笋叶绿体基因组结构和系统进化位置的阐明,可为下一步利用叶绿体基因工程和远缘杂交改良芦笋栽培种打下基础.结果表明,芦笋的叶绿体基因组为一环状DNA分子,全长为156 699 bp(NCBI登录号:NC_034777.1),包括一个大的单一拷贝区(84 999 bp),一个小的单一拷贝区(18 638 bp)和两个反向重复区(26 531 bp);经注释为112个基因,分别是30个tRNAs、4个rRNAs和78个蛋白质编码基因,其中17个基因包含有内含子;经微卫星序列(simple sequence repeat,SSR)分析发现的81个SSR中,其主要是由A和T碱基组成;并且在整个叶绿体基因组序列组成中,芦笋的基因种类、数量和GC含量,与其他天门冬科植物类似;经系统进化分析表明,在天门冬科中芦笋与多花黄精的亲缘关系最近.
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