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针对自适应判决反馈均衡器在恶劣水声通信信道中发散导致数据帧丢失,进而影响Turbo译码性能,提出长交织BI-SOVA译码算法。长交织BI-SOVA译码算法采用对整个数据包(多帧数据)进行编译码,利用长交织的特性,使丢失数据帧的数据随机分布,从而能够纠正丢失的数据帧。针对长交织BI-SOVA译码算法导致的数据存储空间和译码时间的增加,提出采用滑动窗口译码方式和黄金分割互素交织器来优化存储空间以及ADSP-21160中的DMA技术优化运行时延。从实际运行结果来看,在译码相同数据包的情况下,长交织BI-SOVA译码算法与原来的译码算法相比,数据存储空间以及译码时延并没有增加,译码性能有很大的提高,最好情况下能够纠正20%的错误帧。