人卵巢癌组织实时定量PCR内参基因的筛选

来源 :第九届全国生物医学体视学学术会议、第十二届全军军事病理学学术会议暨第八届全军定量病理学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:rette
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在本项研究中选择10个常用的内参基因:ACTB,ALASI,GAPDH,GUSB,HPRTl,PBGD,PPIA,PUM1,RPL29,和TBP,18S rRNA,利用GeNorm,BestKeeper和NormFinder软件分析卵巢癌及正常卵巢组织所有内参基因的表达稳定性,以期为卵巢癌的基因表达调控相关研究提供合适的内参基因。理想的内参基因应具备下列特性:(1)在所有组织、器官、各种细胞类型中表达,是构成细胞的基本成分,维持细胞基本的功能。(2)在所有的环境和实验条件下都稳定表达,不受任何外源和内源因素的影响。(3)具有与目的基因相似的稳定表达水平。RT-qPCR试验中,一些传统的管家基因18SRNA、GAPDH、B2M等被认为在不同的环境条件下均能稳定表达而被作为内参基因。本试验通过BestKeeper、GeNorm、NormFiner软件分析结果可以看出,在不同的卵巢组织中,这些传统的内参基因mRNA表达水平都有一定的变化,个别传统内参基因达丰度太高,不适合做内参基因,如18S rRNA高丰度表达,远远高于其他基因mRNA水平,在定量PCR数据分析时难于扣除基线。因此,依据BestKeeper、GeNorm和NormFiner软件分析结果可以看出,卵巢癌组织HPRTI及TBP稳定性最好,正常卵巢组织ALAS1及GUSB的稳定性最好,2组最佳的内参基因数量为2个。
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