拟位生物信息学分析工具

来源 :2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ninghong0319
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拟位(mimotope)或称“模拟位”或“模拟表位”,是能模拟天然表位与相应抗体结合的多肽。通过噬菌体展示技术,常常能够得到大量拟位及其序列。研究分析这些拟位,在基础研究中往往有助于阐明蛋白质相互作用的位点与网络,在应用研究中有助于诊断试剂、新型药物、疫苗的开发。因此,拟位生物信息学分析工具的研究受到各国研究者的关注。本文在列举现有的6种基于拟位的表位预测方法与工具的基础上,着重介绍了我们新近开发的拟位生物信息学分析工具MIMOX的总体结构与算法,并将其与前述6种工具进行了初步的比较,凸现了MIMOX与操作系统及计算机硬件平台无关并可自由免费使用的特点。本文可望为该领域实验研究者选择合适的生物信息工具提供一个参考。
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