【摘 要】
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多肽自组装不仅可以作为合成新型生物材料的实验手段,也与多种神经系统疾病的成因有密切关系.为了理解微观的短肽分子作用如何决定介观的自组装形貌,用副本交换分子动力学模
【机 构】
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中国科学院理论物理研究所北京市中关村东路55号100190
【出 处】
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国家自然科学基金委员会“可控自组装体系及其功能化”重大研究计划年度会议暨研讨会
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多肽自组装不仅可以作为合成新型生物材料的实验手段,也与多种神经系统疾病的成因有密切关系.为了理解微观的短肽分子作用如何决定介观的自组装形貌,用副本交换分子动力学模拟方法研究了I4K2和KI4K两种氨基酸残基组分相同但是序列不同的短肽在自组装初期的聚集行为.通过对包含三个短肽分子的小体系的副本交换模拟,发现在室温下,两种短肽形成β-sheets的倾向性都很强,但是序列的不同导致组装形貌及出现的几率很不相同.这些不同的出现来源于由氢键连接在一起的相邻分子侧链间的静电和疏水相互作用的竞争.模拟结果不但揭示了I4K2和KI4K在实验中出现不同自组装形貌的分子根源,而且显示了在短肽自组装中静电、疏水、氢键和范德华力之间的微妙平衡与竞争的关系.
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