【摘 要】
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目的 利用生物信息分析方法预测探索苗药双藤汤中化学组分治疗人类类风湿关节炎(RA,rheumatoid arthritis)的效应靶基因。方法 从公共基因芯片数据库GEO筛选符合纳入条件
【机 构】
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贵阳中医学院苗药协同创新中心 贵州 贵阳 550025
【出 处】
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2017《中国医院药学杂志》学术年会
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目的 利用生物信息分析方法预测探索苗药双藤汤中化学组分治疗人类类风湿关节炎(RA,rheumatoid arthritis)的效应靶基因。方法 从公共基因芯片数据库GEO筛选符合纳入条件的人RA滑膜组织全基因组RNA芯片(样本为RA患者和正常人的滑膜组织)利用GCBI在线实验室筛选出RA与正常组织的差异基因数据集A；从BATMAN中药化合物数据库搜寻苗药双藤汤所含药物成分作用的效应基因数据集B,分别对上述两个数据集及两者的交集通过GCBI进行GO富集分析、KEGG通路分析以及参与生物功能的蛋白相互作用网络分析(PPI分析)。结果 从符合研究纳入条件的3块RA患者与常人滑膜组织基因芯片数据集最终得到192个差异性基因,从BATMAN中药化合物数据查到双藤汤的药物组分调节基因87个,交集得到TYMS、PRKCB、ALOX5、COL5A1、ITGB2共5潜在效应靶基因,后续生信分析及文献回溯证实这5个基因紧密联系在NFκB周围,尤其与叶酸代谢相关通路密切联系,预示双藤汤有可能通过调节RA滑膜细胞叶酸代谢到达抗炎效果。结论 利用生物信息学有助于苗族草药复方成分针对RA滑膜组织的治疗效应靶基因探索,为进一步的实验研究指明方向,提供理论依据。
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