野牦牛属高寒地区的特有物种,是我国最珍贵的野生动物遗传资源之一,动物线粒体基因组(mtDNA)具有进化速率快、多态性丰富、无重组等特点,被广泛应用于动物起源、演化和分类,以及群体遗传结构、亲缘关系等研究.本研究对野牦牛mtDNA进行全序列测定和结构分析，并结合GenBank中家牦牛、普通牛、瘤牛、美洲野牛等的相应序列分析研究了其分类学地位。结果表明:(1)野牦牛线粒体基因组全序列的大小为16322bp，整个基因组由37个编码基因和D-loop区组成，分别位于L链和H链;22个tRNA基因序列长度为1524bp、2个rRNA基因序列长度为2528bp、13个编码蛋白基因序列长度为11420bp、D-loop区长度为892bp将野牦牛与家牦牛、普通牛、水牛、美洲野牛、羚羊、白犀牛、印度犀牛、绵羊线粒体基因组全序列进行比对和聚类分析，构建系统进化树，结果牦牛与野牦牛首先聚为一类，接着与美洲野牛相聚成一大类;普通牛与瘤牛聚为一类，再与水牛聚为一大类。牦牛为牛亚科中的一个独立属，即牦牛属(Poephagus)，牦牛属包括家牦牛(Poephagusgrunniens)和野牦牛(Poephagus mutus)2个种。野牦牛线粒体基因组全序列的获得和结构解析对研究牦牛的起源、演化和分类，以及野牦牛遗传资源的保护、开发和利用均具有重要的理论和实际意义。