创伤弧菌和聚肌胞协同诱导的斑节对虾基因差异表达分析

来源 :2012年中国水产学会水产生物技术专业委员会年会暨水产基因与种业学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Tsianyong
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  养殖水环境中的有害微生物是对虾健康养殖的极大威胁,细菌和病毒协同感染导致病害加剧,为探讨在此过程中对虾机体的生理生化变化,利用高通量测序技术,对创伤弧菌(Vibrio vulnificus)和病毒类似物聚肌胞(poly(I∶C))共同刺激后的斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组进行差异表达分析.利用Illumina/Solexa平台,获得约24.6M条100nt reads,以已测序获得的肝胰腺转录组为模板,利用DEGseq软件分析后揭示创伤孤菌和聚肌胞诱导了3,025条不同功能分类的转录本显著上调或下调,涉及细胞、细胞组分、结合、催化、细胞学过程、代谢等多个过程.此外,分析结果表明虾类的天然性免疫组分与脊椎动物具有很高的保守性.该结果整体性调查了对虾受到细菌和病毒共同感染后防御基因的变化情况,为深入研究对虾的非特异性天然免疫机制奠定基础,亦为探讨无脊椎动物免疫系统的起源与进化提供参考.
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