Label free方法筛选降解苦马豆素蛋白

来源 :中国畜牧兽医学会家畜内科学会2014年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:buzi899
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  动物疯草中毒病严重制约着我国西部畜牧业的生产.动物采食疯草后可引起慢性神经机能障碍.苦马豆素(swainsonine,SW)是疯草中的主要毒性成分.但疯草具有返青早,枯萎迟,蛋白含量高,对动物适口性好等优点,更适合草资源相对匮乏,生态环境脆弱的西部草场利用.为去除SW,本实验室前期分离出了能够降解SW的Arthrobacter sp.HW08菌,并对其特性进行了研究,证明该菌的胞内酶具有降解SW的能力.本研究旨在探查Arthrobacter sp.HW08降解SW的相关差异表达蛋白谱,筛选降解SW的功能蛋白.本试验利用label free定量蛋白质组学技术分析比较SW诱导与未经SW诱导的HW08菌,根据蛋白质的基因本体注释对所鉴定蛋白进行分类分析;并通过实时荧光定量PCR法验证相关差异蛋白.结果显示,共鉴定到2043个蛋白,经iBAQ方法差异性比较,选择2倍以上(t检验P<0.05)的结果获得129个与降解SW相关的差异表达蛋白.SW诱导后45个蛋白表达量上调,84个蛋白表达量下调.其中,10个为诱导前HW08菌中特有,8个为诱导后HW08菌特有.对129个差异蛋白按其GO注释分别进行细胞组件、分子功能及生物学过程分类后发现,差异表达蛋白主要来自于细胞、细胞膜及细胞器,以催化和结合功能为主,参与代谢、细胞生物过程居多,其次参与生物调节、应对刺激等生物学过程.根据这些差异蛋白参与的生物学过程和功能,从中筛选了12对蛋白.通过实时荧光定量PCR验证得到了与降解SW相关的4组蛋白,分别是异构酶(A1R5X7)、氧化还原酶(A1R5X8)、脱氢酶(A1R6C3)、乙酰基转移酶(A0JZ95).它们在KEGG中分别参与有机物分解过程、细胞代谢过程,异构酶活性;羧酸代谢过程,醛糖和酮糖互换,氧化还原酶活性;糖异生/降解脱氢酶、己内酰胺降解脱氢酶;苯甲酸降解、乙苯降解等乙酰转移酶作用.结果提示这些蛋白为进一步分析Arthrobacter sp.HW08降解SW的生物学机制,构建转基因工程菌提供科学数据.
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