基于454测序和基因芯片鉴定低温诱导牡丹休眠解除的相关基因

来源 :2013中国洛阳国际牡丹高峰论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ashwgs
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  牡丹是原产中国的特色名花.休眠花芽必须经过一定低温打破休眠启动生长和开花.根据移入温室后花芽的萌动情况判断,凤丹经过18d的低温可解除休眠.利用454测序平台,测定了休眠花芽的转录组,共获得了625 342个reads,平均长度358.1 bp,组装成23 652个eontigs.对大于300 bp的进行了注释,其中12 345个EST与数据库中的已知基因同源(E-value <1e-10).利用获得的EST序列定制了牡丹芯片,用来分析休眠解除进程中的基因表达变化.ANOVA分析共检测到3 174个与休眠解除相关的差异表达基因.聚类分析表明与GA信号转导和响应有关的基因可能参与了休眠解除,碳水化合物代谢、能量代谢和细胞生长有关的基因上调表达.GA途径的激活是牡丹休眠解除的重要原因.
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