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隐孢子虫和十二指肠贾第虫是引起奶牛,特别是犊牛腹泻的两个重要的肠道寄生原虫.两个寄生原虫还具有重要的公共卫生学意义.本研究的目的是确定隐孢子虫和十二指肠贾第虫在犊牛中的感染率,以及确定感染种类或基因型以评估其潜在的公共卫生学意义.以河南省郑州市郊区某大型奶牛场作为调查点,所有0～3月龄的犊牛作为调查对象,连续采集6次,共采集272份奶牛粪样.采用显微镜观察法、、基于18S rRNA和gp60的PCR扩增方法对隐孢子虫进行研究分析,十二指肠贾第虫的研究则采用显微镜观察法、多位点基因(16S rRNA,gdh,tpi,和bg)的扩增方法.在所收集的272份犊牛粪便样品中,贾第虫通过显微镜观察法、PCR扩增法检测的阳性率分别为9.5％ (26/272)和36％ (98/272),而隐孢子虫则相应的分别为7.3％ (20/272)、31.9％ (87/272),其中7周龄的犊牛贾第虫感染率达到最高峰,9周龄的犊牛隐孢子虫感染率达到最高峰.对于贾第虫,共鉴定出三个基因型,分别为基因型E(92个)、基因型A(4个)、基因型B(1个),以及基因型A和基因型E混合感染型(1个)；对于隐孢子虫,共鉴定出四种隐孢子虫,分别为C.ryanae(32个)、C.andersoni(28个)、C.bovis(23个)和C.parvum(4个),C.parvum的基因亚型为ⅡdA15G1.实验数据表明,不同的检查方法感染率存在显著的差异性,我国中原地区犊牛的十二指肠贾第虫和隐孢子虫感染率远远高于先前的报道,同时两种寄生原虫在奶牛和人类人畜共患病传播上具有潜在的危险性.