基于RefGene和GenBank公共数据集的人类成熟mRNA上游开放阅读框的分析

来源 :广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lpucicy
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  上游开放阅读框(uORF)是成熟mRNA的5UTR中一种转录后调控元件,它能够调控下游主要开放阅读框(mORF)的翻译水平.过去的研究表明,发生于uORF区域的突变,特别是使得起始密码子,终止密码子产生或消失的突变,能够导致mORF翻译水平的显著变化,导致遗传病的发生.目前,还没有系统性的研究,对不同种类疾病的患者DNA测序发现的突变与uORF的状态相联系.这里,我们利用公共数据集:人类RNA GenBank数据和RefGene数据,对人类成熟mRNA的uORF做一个更新性的探索,包括GO的注释和序列特征分析.GO注释表明,含有uORF的基因在功能上通常富集于某些特定的亚集,如癌基因,神经组成,转录因子等.
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