绿竹成花基因BoTFL1的克隆及生物信息学分析

来源 :中国林学会竹子分会四届四次全委会暨第六届中国竹业学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:asicsyao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
利用禾本科植物TFL1同源基因在序列上的保守性,设计简并引物,采用RT-PCR技术与RACE技术从白绿竹中克隆到开花抑制基因BoTFL1.其cDNA序列全长为833bp,包含完整的开放阅读框为522bp,编码173个氨基酸。二级结构预测表明,该蛋白具有丰富的无规卷曲(random coil),同时含有β转角结构(beta turn)以及延伸结构(Extended strand).基于最大似然法构建系统进化树,对20个物种的TFL1基因的氨基酸序列分析表明,绿竹的BoTFL1基因与高粱、玉米、水稻等禾本科植物的TFL1同源基因均有90%以上的同源性。
其他文献
The effects of nitric oxide (NO) on browning and lignification of bamboo shoots were investigated.Bamboo shoots were dipped for 1 h in 0.5 mM sodium nitroprusside (SNP ),a nitric oxide donor,then pack
通过对比试验调查了竹腔竹蔸施肥的效果,结果表明:施肥林分与对照林分相比,除林分平均胸径没有差异外,林分立竹度、新竹量、新竹胸径、发笋数、成竹率分别提高了16.2%、53.6%、6.9%、49.3%和7.9%,总体效果明显;不同施肥类型相比,以竹腔施肥为好.并对加强竹腔(蔸)施肥提出了建议.
2008年1月下旬至2月初,江西省出现了罕见的雨雪冰冻天气,毛竹林受灾严重。为使江西省受灾毛竹林在3—5年时间内,毛竹资源恢复到灾前水平。江西省政府决定对300万亩毛竹林实施竹腔施肥。全省确定了22个省级示范林,开展毛竹注射BNP试验示范。大余县营建毛竹林省级示范林一块,面积38.7hm2,示范林平均受灾率达45.1%,采用固定样地调查方法,2009年(大年)施肥样地比对照样地平均多长新竹33.3
2007年以来,笔者在安徽省广德县采取踏查、样点详查等方法,对竹林丰产增效工程实施情况进行了全面调查研究,认真总结归纳了所采取的技术措施,客观分析了所取得的成效,提出了竹林高效可持续经营建议,以指导今后竹业发展.
毛竹是中国南方重要的森林资源,对南方毛竹林采取平衡施肥等集约培育措施的结果表明,平衡施肥能显著的提高毛竹的胸径和竹笋的营养品质.同时,对集约经营毛竹林的纯收入的分析表明,N2P1K2是经济效益最高的施肥配比.平衡施肥不仅能减少肥料浪费和环境污染,还能显著增加毛竹林经营的经济效益及产值.南方毛竹林集约经营平衡施肥措施是提高林分生产力,显著增加经济和生态效益的保障.
本文针对天然筇竹林因长期人为干扰而出现的无性系种群退化和林分健康水平下降的现状,在分析天然筇竹林可持续经营的社会、经济、环境和发展等目标的基础上,研究提出了区域化经营、分类经营、生态系统管理和产业化经营等可持续经营的途径.
Bamboo shoots grow quickly through the rapid elongation of internodes,but the preeise molecular mecha- nisms underlying this process remain unknown.We used a combination of suppressive subtractive hyb
Public sequence databases provide a rapid,simple and cost-effective source of microsat- cllite markers.We analyzed 1.532 bamboo (Phyllo- stachys pubescens) sequences available in public domain DNA dat
从绿竹中克隆得到EMF2的同源基因,命名为BoEMF2,cDNA全长2500bp,CDS长1893bp,编码630个氨基酸残基。序列分析表明,BoEMF2包含VEFX-BOX家族典型的酸性氨基酸簇区域和锌指结构域,位点479K、480L、481S、483R、484A、485D、486P、490L、494Q、495L等,是重要的功能位点。进化分析表明,绿竹BoEMF2基因与竹类植物麻竹(Dendro
据已报道的CBF1(CRT-Binding factor1)基因的cDNA序列设计简并引物,从慈竹叶片中提取总RNA,通过RT-PCR的方法获得663 bp的完整开放阅读框(ORF,Open Reading Frame).采用RACE技术克隆得到全长基因序列,将克隆的慈竹CBF1基因的cDNA序列连接到植物表达载体pBI121中CaMV35S启动子的下游,成功构建了慈竹CBF1基因的过表达载体pB