品种鉴定是种质资源研究和新品种保护的基础，本研究在形态学鉴定的基础上，通过ISSR和SSR标记，对具有10多年树龄的3株疑似北京28变异材料及来自同一果园和不同果园对照未变异北京28进行分子鉴定。结果发现：30对SSR标记在供试材料间不具有多态性：39条ISSR引物共扩增出314条DNA片段，其中36条具有多态性，多态性频率为11.46％；材料间遗传相似系数变幅为0.91～0.99，平均为0.95。来自同一果园的两对照未变异北京28号间遗传相似系数为0.96，3株疑似变异材料间遗传相似系数达到0.99，说明3株疑似变异材料为相同变异品种。通过UPGMA聚类分析发现，当遗传相似系数为0.96时，三株疑似变异材料与来自同一果园的两对照未变异北京28聚为一类群，且与对照C2亲缘关系最为密切，说明3株疑似变异品种很可能是由对照C2变异而来。与来自同一果园两对照未变异北京28相比，变异材料部分ISSR标记位点存在差异，结合表型变异，说明变异材料为一桃新品种。