不同来源的副溶血性弧菌CRISPR检测及其比较分析

来源 :中国食品科学技术学会第十三届年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:stormcn
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  为了探究不同来源的副溶血性弧菌的规律成簇间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)特点,本研究对42株临床分离菌株和37株环境分离菌株的CRISPR进行PCR扩增,并且通过CRISPR Finder分析79株副溶血性弧菌的CRISPR序列,结果发现在所有检测阳性的环境菌株中CRISPR序列高度一致,而较环境菌株相比临床菌株的CRISPR的间隔序列存在单核苷酸多态性,并且有新的间隔序列插入到CRISPR位点中。通过数据库比对所有检出间隔序列,未发现与其序列高度同源的质粒或噬菌体,特别的是一间隔序列却与副溶血性弧菌自身蛋白基因高度同源。副溶血性弧菌中CRISPR普遍存在,但多样性较低,这或许预示着副溶血性弧菌CRISPR还具有另外的未知功能。
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