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本研究以广西富含Fe、Mn元素的典型水稻田及甘蔗田中不同土壤深度的Fe-Mn结核为研究对象，以16S rRNA为目标分子，应用454高通量测序技术结合常规理化分析，结果表明：1.Fe-Mn结核对Fe元素的富集系数为周围土壤的3倍，而且主要是以游离态Fe形态存在的.2.对于Si02、A1203等与风化相关物质来说，铁锰结合的风化程度低于外围土壤。3.Fe-Mn结核中，游离态Fe作为可利用的部分，其含量与alpha微生物多样性成正相关，而高浓度Mn作为有毒物质与多样性成负相关。4.Fe-Mn结核内部与其周围土壤的微生物群落组成差异不大。