基因全基因组测序的东乡野生稻内生放线菌PRh5的次级代谢产物合成分析

来源 :第二届中国放线菌生物学与产业化研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wfzhousd
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Streptomyces sp.PRh5是从东乡野生稻中分离获得的一株对细菌和真菌都具有较强抗菌活性的内生放线菌.为了进一步深入研究PRh5抗菌机制,本研究采用高通量测序技术对PRh5菌株进行全基因组测序,组装得到290 contigs,整个基因组大小约11.1 Mbp,GC含量为71.1%,序列已提交至GenBank数据库,登录号为JABQ00000000.基于Glimmer 3.0软件,Streptomyces sp.PRh5共预测得到8712个蛋白基因,其中6677个蛋白基因成功获得COG功能注释(图1).
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