不同海拔齿果酸模居群cpDNA psbA-trnH序列特征分析

来源 :2015中国植物学会第十三届全国药用植物及植物药学术研讨会暨2015年海峡两岸中医药科学交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ajie830510
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  蓼科酸模属(Rumex L.)为蓼科第二大属,植物种类多,大部分多年生草本根部均可药用,是重要的传统医药资源.以该属齿果酸模(Rumex dentatus L.)5个居群39个样品为研究材料,通过PCR技术扩增DNA条形码后备序列——叶绿体psbA-trnH基因片段并测序,然后利用生物学软件分析序列特征以及不同野生居群遗传多样性.结果表明,翅果酸模psbA-trnH序列长度范围在278-292bp之间,GC含量为31.51-33.45%.BioEdit软件排列比对后长度为288bp,其中有15个信息位点,包括5个点突变,其余均为碱基缺失,该序列在齿果酸模中存在1个多碱基缺失,分别是在97-106bp(GTATTCATTA),研究的39个样品中有18个发生该缺失.根据该序列,DnaSP软件分析表明齿果酸模核酸多样性(pi)为0.00169,平均变异数目为0.486,构成14个单倍型,单倍型多样性为0.8947.其中居群2(海拔3445m)多样性最高,其次是居群1(海拔3343m),而居群3、4、5遗传多样性为0,即居群内未出现分化.居群间的遗传距离在0.0-0.046之间.结果表明,不同海拔齿果酸模居群之间遗传分化不明显,远低于异交生物平均水平.该结果可能与齿果酸模为克隆繁殖、高适应能力、种子传播范围广等生活史策略相关.同时也表明psbA-trnH序列在齿果酸模居群水平上分辨率达不到鉴别可行性,不能单独作为该药材的条形码.
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