基于全基因组SNP标记的鸡遗传进化分析

来源 :江苏省遗传学会2016年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangyang03
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  本研究旨在利用全基因组SNP标记分析部分地方鸡种的遗传进化.以9个地方鸡品种(萧山鸡、鹿苑鸡、藏鸡、茶花鸡、大骨鸡、北京油鸡、固始鸡、仙居鸡、白耳黄鸡)和1个引入品种隐性白羽肉鸡为素材(每个品种10公、20母),构建pair-end文库进行RAD-seq简化基因组测序.通过数据质控,在10个鸡种群体中鉴定出SNP标记683,558个,其中藏鸡、茶花和大骨鸡SNP数量超过400K,隐性白羽肉鸡中也达到了392K.
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