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内生真菌J46菌丝体及其发酵液对单子植物的除草作用大于双子叶.苗前土壤处理J46菌丝体片段悬液对小麦、马唐、雀麦、水稻、稗草、狗尾草的出芽抑制率分别为94.1％、85.2％、83.3％、71.4％、70.0％、66.7％; J46发酵液对稗草、雀麦、狗尾草、马唐、早熟禾的出芽抑制率分别为95.0％、92.0％、91.8％、86.7％、85.8％.苗后叶面处理J46菌丝体活体能使单子叶植物小麦、狗尾草、稗草、早熟禾染病.从内生真菌J46发酵液中分离鉴定出3种除草活性化合物,分别为环-(L-亮氨酸-L-脯氨酸)二肽、细交链孢菌酮酸及Vivotoxin Ⅱ.