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全二维气相色谱柱系统选择时要视所分析样品的性质并综合考虑两维的分离特性后再作出判断。在我们过去的研究过程中发现，即使是采用非常相似的柱系统，即两维的固定相略有差异时，得到的GC×GC分离情况仍然不一样，这就不能简单地从宏观的极性与非极性的角度去分析，而必须从微观的角度出发，结合固定相与待测样品分子间的作用力方面去解释这一问题，然后才能对柱系统作出合理选择。与1DGC一样，GC×GC选择柱系统的主要依据也应该是色谱柱的性能和固定相的选择性。因此，本文分别对四套柱系统(主要是第一柱)的性能和固定相的选择性进行评价，从分子水平上探讨柱系统的选择对GC×GC正交分离的影响。