本工作采用甲醇水溶液对含有4％SDS的蛋白质样品进行稀释后，利用自制中空纤维膜接口的透析作用，除去蛋白质样品中的SDS的同时，也将样品溶液置换为适宜酶解的缓冲体系，通过后续串联的固定化酶反应器，直接获得可进行LC-MS分析的蛋白质酶解产物，实现高效快速的SDS辅助溶解蛋白质样品的一体化预处理。将该种样品预处理方法应用于鼠脑全蛋白质组的分析研究，采用4%SDS溶解鼠脑全蛋白样品，经过膜接口处理后，在线酶解的样品采用2D nano-LC-ESI-MS/MS分析，共鉴定到Protein groups:2906，Unique peptides:10852。作为对比，利用目前应用广泛的SDS去除方法:Filter-aided sample preparation (FASP)流程处理相同样品，结果鉴定到Protein groups:2574，Unique peptides:7790。结果表明基于中空纤维膜接口的处理方法能够有效去除蛋白质样品中SDS，同时一体化处理有效的减少样品损失，为实现快速便捷的大规模全蛋白质组分析奠定基础。