本研究首先回顾了长江鱼类的资源状况，然后以长江鱼类天然捕捞量、四大家鱼鱼苗调查量和长江口鳗鲡苗捕捞量严重下降为例，反映了近60年来过度开发引起渔业资源枯竭的现状。接着列出了长江鱼类所面临的 6 个威胁：(1)干流水利工程的前期施工；(2)支流盲目建设的小水电；(3)采砂场；(4)过度捕捞；(5)大坝阻隔了鱼类基因交流；(6)盲目放生，导致外来种入侵。最后针对上述 6 大威胁，提出了 8 个保护措施的建议：(1)规划自然保护区，保护栖息地；(2)应用生态水工理论，进行合理的生态调度；(3)开展鱼类科学研究，进行人工种质资源的补偿；(4)限制涉水工程和支流水电开发；(5)流域内进行废渣污水处理；(6)加强渔政执法，建议开展10年禁渔活动；(7)规范鱼类放生种类，避免外来鱼类打败土著鱼类；(8)建立鱼类增殖放流站，开展增殖放流活动。