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城市代谢和城市形态已成为解决城市生态系统病症的双向研究切入点。本文立足于环境工程学和建筑学学科，通过综述目前国内外城市代谢和城市形态的概念、方法和内容而总结城市代谢和城市形态交叉研究的不足；基于此，本文通过整合城市代谢的物质流、能量流和生态足迹分析以及城市形态的生物气候、功能结构和生态模式分析而从理论、内容和方法层面提出基于城市生态系统的生态关联研究的途径以为未来生态城市设计提供理论指导。