【摘 要】
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由尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)引起的豆科、葫芦科、茄科等100多种植物根腐病、茎腐病、茎基腐病等,严重影响着上述植物的健康生长,给生产生活造成了重大经济损失.F.oxysporum属于半知菌类真菌,是一种以土壤习居为主要特征的植物病原真菌,广泛分布于世界各地.前人研究发现,F.oxysporum的主要致病机制在于侵染并破坏寄主植物的维管束组织,从而导致植物不能实现正常的营养和
【机 构】
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西南林业大学生物多样性保护与利用学院,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224
【出 处】
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第十三届全国青年植保科技创新学术研讨会暨全国植物保护博士后论坛
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由尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)引起的豆科、葫芦科、茄科等100多种植物根腐病、茎腐病、茎基腐病等,严重影响着上述植物的健康生长,给生产生活造成了重大经济损失.F.oxysporum属于半知菌类真菌,是一种以土壤习居为主要特征的植物病原真菌,广泛分布于世界各地.前人研究发现,F.oxysporum的主要致病机制在于侵染并破坏寄主植物的维管束组织,从而导致植物不能实现正常的营养和水分运输功能,引起植物根腐、茎腐、茎基腐等症状,严重时甚至造成植株萎蔫死亡,严重影响着植物的产量和品质.同时,前人研究表明,植物病原真菌、卵菌以及细菌中存在着大量的分泌蛋白,其在侵染植物的过程中发挥着重要的作用,不仅有助于实现其对植物的侵染、定殖和扩散,而且有助于形成对抗植物免疫防卫反应的效应分子、信号分子和诱饵蛋白.然而,对于尖孢镰刀菌的分泌蛋白尚未明确,因此本研究以全基因组序列中已经公布的尖孢镰刀菌菌株(F.oxysporum f.sp.lycopersici4287)中的蛋白序列为基础数据,以真菌分泌蛋白所具有的特征(N-端含有信号肽、不含有跨膜结构域、没有GPI锚定位点、将蛋白分泌在胞外)为依据,利用SignalP v3.0、ProtCompB v9.0、TMHMM v2.0、big-PI Fungal predictor、TargetP v1.1等生物信息学分析程序筛选、获得分泌蛋白,同时,对其氨基酸组成及分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等特征进行分析,结果表明:尖孢镰刀菌中分泌蛋白数量为778个,其氨基酸长度多集中于101～400AA,所占比例为57.07％,氨基酸组成中以G(甘氨酸)最多,所占比例为9.20％;信号肽长度以16～21aa最多,所占比例为81.49％,信号肽氨基酸残基中以P(脯氨酸)最多,所占比例为9.12％;信号肽切割位点-3～3氨基酸组成中最多的分别是T(苏氨酸)、S(丝氨酸)、T、A(丙氨酸)、S、S,信号肽切割位点属于T-X-A类型,属于SPⅠ型信号肽识别位点,具有相对保守性特点.
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