【摘 要】
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目的 戈登菌与分枝杆菌同属于抗酸染色阳性菌,且能够引起疑似结核病的肺部感染,在临床容易被误诊为结核病,对大多数抗结核药天然耐药,通过支气管戈登菌临床株的mmpL3(Rv0206c)同源基因进行序列分析,并对其蛋白质进行结构及功能预测,为后期的抗酸染色阳性菌诊断,药物靶标的筛选提供理论基础. 方法 根据全基因组测序结果和同源比对找到支气管戈登菌的mmpL3同源基因,应用expasy工具预测支气管戈登
【机 构】
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430023 武汉轻工大学生物与制药工程学院 上海交通大学基础医学院免疫与微生物学系
【出 处】
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全国结核病诊疗与防控暨第二届抗结核药物不良反应防治新进展研讨会
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目的 戈登菌与分枝杆菌同属于抗酸染色阳性菌,且能够引起疑似结核病的肺部感染,在临床容易被误诊为结核病,对大多数抗结核药天然耐药,通过支气管戈登菌临床株的mmpL3(Rv0206c)同源基因进行序列分析,并对其蛋白质进行结构及功能预测,为后期的抗酸染色阳性菌诊断,药物靶标的筛选提供理论基础. 方法 根据全基因组测序结果和同源比对找到支气管戈登菌的mmpL3同源基因,应用expasy工具预测支气管戈登菌MmpL3同源蛋白理化性质；使用PSORTb分析蛋白质的亚细胞定位；蛋白质信号肽预测采用SignalP在线软件进行预测；利用Interproscan和Gene ontology工具对蛋白保守序列和功能进行预测；使用TMHMM在线工具进行拓扑结构预测. 结果 利用Blastp同源搜索找出MmpL3同源蛋白(Gbro4481),ProtParam分析得知,Gbro4481蛋白的氨基酸个数为1095,分子量为116.0512 kDa,理论与等电点为8.94,理论分子是为C5159H8270N1450Oi 522S34,PSORTb version 3.0预测其在细胞质膜表达,SignalP预测发现Gbro4481不存在信号肽切割位点,未发现信号肽存在,并预测其有10个跨膜区,N端和C端都在在胞外；MmpL3有两个保守结构域和一个固醇敏感多肽区；二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主.结合亚细胞定位、GO和结构分析显示其是一个细胞质膜上的膜蛋白. 结论 支气管戈登菌的Gbro4481为H37Rv的MmpL3同源蛋白,推测Gbro4481的功能同MmpL3相似,是分枝菌酸的转运蛋白,参与胞内小分子的运输和信号转导.
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