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20世纪末(1999年)，我国高等教育确立了中央和省(自治区、直辖市)两级办学的财政管理体制，本文对此后的2001-2010年近十年我国地方普通高校预算内生均经费支出的地区差异及其原因进行实证研究。研究结果表明：我国地方普通高校预算内生均经费支出的基尼系数先略有上浮，后微微下降；生均教育事业费对生均经费差异的贡献率逐渐扩大至90％；人均财政收入、人均工资和普通高校学生数占总人口比通过作用生均事业费对地方普通高校预算内生均经费差异产生显著影响。