鸭YAP1基因编码区克隆、生物信息分析及其组织表达特性

来源 :四川省畜牧兽医学会2014学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:MM27291457
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目的:旨在克隆鸭YAP1基因,预测其蛋白结构、功能及其组织表达特性.方法:以北京肉鸭为材料,采用RT-PCR技术克隆鸭YAP1基因CDS区,利用多种生物信息学分析软件预测其结构与功能,并应用荧光定量PCR检测其组织表达谱.结果:结果表明:鸭YAP1基因CDS全长1248bp,编码415个氨基酸,氨基酸水平上与鸡相似性高达99.7%,与参与比较的哺乳动物相似性均高于90%;氨基酸序列分析发现鸭YAP1蛋白相对分子量为45417.5Da,理论等电点为5.15,主要定位在细胞核,属水溶性蛋白,无信号肽与跨膜结构,不属于分泌蛋白;预测鸭YAP1氨基酸含有磷酸化、糖基化位点各30个;含两个WW结构域,且不同物种间结构域较保守;二级结构以无规则卷曲为主,三级结构呈弯曲状螺旋结构;荧光定量结果显示,YAP1在胰脏中表达量最高,可能在胰脏中起关键作用.结论:由研究结果与分析推测,鸭等鸟类YAP1基因功能与哺乳动物具较高一致性.以上研究为进一步探讨YAP基因在鸟类中的作用提供了参考.
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