甘肃省冬小麦苗期根腐病发生比较普遍，田间发病率为10-20％，严重的地区达50％以上.从甘肃冬小麦主要分布区的定西市安定区、漳县、陇西县，白银市会宁县，天水市甘谷县、清水县和麦积区，庆阳市镇原县等8个县(区)采集田间表现根腐病症状的苗期冬小麦样本，并通过常规方法对发病植株根部真菌分离纯化，并根据菌株的培养特征和真菌形态进行鉴定；在此基础上，对各县(区)的感病冬小麦根部真菌组成进行聚类分析和多样性指数分析.结果显示，各样本共分离得到176株菌，包括镰刀菌属(Fusarium spp.)、平脐蠕孢属(Bipolaris spp.)、向基孢属(Basipetospora spp.)、卵蠕孢属(Marielliottia spp.)、枝顶孢属(Acremonium spp.)、弯孢属(Curvularia spp.)等16个属，其中，镰刀菌属(Fusarium spp.)分离频率最高，占33％，属优势菌，其次是平脐蠕孢属(Bipolaris spp.)，占17％.相似性分析表明，不同地区根腐病小麦内生真菌在组成上存在差异，但优势种群差异度不大，除甘谷以平脐蠕孢属为优势种群外，其他地区均以镰刀菌属为优势种群.多样性分析发现，甘谷县和陇西县的Shannon's指数和Simpson's指数较高，其他地区相对较低，且各不相同.说明甘肃省冬小麦苗期根部真菌组成具有多样性，不同地区样本真菌多样性存在差异，且多样性与冬小麦苗期根腐病田间发生的严重度呈负相关.